Anime ini merupakan lanjutan dari anime Full Metal Panic, tetapi setting cerita ini lebih menekankan kehidupan di sekolah Kaname Chidori dan Sagara Sousuke bersama dengan teman-teman sekolah mereka. Berbeda dengan seri anime Full Metal Panic yang sebelumnya, kali ini Fumoffu lebih menonjolkan sisi komedi dari kehidupan Chidori dan Sousuke sehari-hari tanpa adanya ancaman dari teroris atau sejenisnya.
